Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 HSM3YBR272C 1443 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 NOG2YNR053C 1461 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 RRP3YHR065C 1506 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CCT5YJR064W 1689 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GUF1YLR289W 1938 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 MRH1YDR033W 963 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YDR445CYDR445C 408 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SLD5YDR489W 885 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 LSB1YGR136W 726 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YPT35YHR105W 645 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 TAL1YLR354C 1008 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 BUB2YMR055C 921 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 STE3YKL178C 1413 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 UGA2YBR006W 1494 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 NAM8YHR086W 1572 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 FLC2YAL053W 2352 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 UBP9YER098W 2265 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 LRP1YHR081W 555 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SQT1YIR012W 1296 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 RTT109YLL002W 1311 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 ACO1YLR304C 2337 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 JLP2YMR132C 627 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 RCK2YLR248W 1833 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 ENB1YOL158C 1821 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 EDC3YEL015W 1656 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YPL247CYPL247C 1572 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GAS4YOL132W 1416 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 DAD1YDR016C 285 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 FIN1YDR130C 876 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 ARC1YGL105W 1131 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 COX13YGL191W 390 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YIL029CYIL029C 429 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YJR037WYJR037W 384 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YLR297WYLR297W 390 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 APT1YML022W 564 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SEC23YPR181C 2307 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CCC2YDR270W 3015 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CDC23YHR166C 1881 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GEX1YCL073C 1848 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 UTP18YJL069C 1785 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 MTC6YHR151C 1581 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 ALD2YMR170C 1521 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GPA1YHR005C 1419 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CAD1YDR423C 1230 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 LIF1YGL090W 1266 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 NAS2YIL007C 663 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CAP2YIL034C 864 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GCD14YJL125C 1152 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YLR290CYLR290C 834 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SPE2YOL052C 1191 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GCY1YOR120W 939 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 DSS4YPR017C 432 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CHK1YBR274W 1584 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 PET494YNR045W 1470 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 JJJ1YNL227C 1773 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 GAL80YML051W 1308 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 MET32YDR253C 576 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 NIF3YGL221C 867 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SEN34YAR008W 828 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 CAT5YOR125C 702 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 ATE1YGL017W 1512 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YER119C-AYER119C-A 372 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 RPN11YFR004W 921 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 SLX9YGR081C 633 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YJL064WYJL064W 396 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 RAD33YML011C 534 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 AIM32YML050W 936 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 YNL295WYNL295W 1575 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 PDH1YPR002W 1551 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 BAP3YDR046C 1815 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-BRQ12217 BNA5YLR231C 1362 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 RPL35BYDL136W 363 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 GUK1YDR454C 564 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YIL161WYIL161W 708 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YJL043WYJL043W 774 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YKL118WYKL118W 312 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 REX2YLR059C 810 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 ARC18YLR370C 537 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YMR141CYMR141C 309 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YMR254CYMR254C 309 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 RCF2YNR018W 675 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 MHF1YOL086W-A 273 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YML020WYML020W 1995 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 CKI1YLR133W 1749 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 GDH1YOR375C 1365 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 DCR2YLR361C 1737 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 TAM41YGR046W 1158 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 QCR8YJL166W 285 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 HIT1YJR055W 495 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YOR053WYOR053W 342 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YKL075CYKL075C 1353 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 YCR061WYCR061W 1896 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 AZR1YGR224W 1842 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1A-BRQ12217 snR9snR9 187 nt6.56□□□□□ -1.36
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