Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 PIR3YKL163W 978 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YLR326WYLR326W 723 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 PEX12YMR026C 1200 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SLZ1YNL196C 897 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YPR202WYPR202W 717 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 PUT1YLR142W 1431 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RTK1YDL025C 1863 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 MET4YNL103W 2019 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 URC2YDR520C 2319 nt4.34□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 RIA1YNL163C 3333 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 MCD4YKL165C 2760 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 HPR1YDR138W 2259 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 ABP140YOR239W 1887 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PEX30YLR324W 1572 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 RRB1YMR131C 1536 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YET2YMR040W 483 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 ERD2YBL040C 660 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 AKL1YBR059C 3327 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 RAD54YGL163C 2697 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 APC4YDR118W 1959 nt4.33□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 IME4YGL192W 1803 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 BUD8YLR353W 1812 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 MIS1YBR084W 2928 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 GLO3YER122C 1482 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 TDA6YPR157W 1404 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 VAC17YCL063W 1272 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YCL075WYCL075W 441 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 BUD30YDL151C 582 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PCL9YDL179W 915 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 HNT2YDR305C 654 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PRM10YJL108C 1152 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 APS1YLR170C 471 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLR462WYLR462W 609 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 REX4YOL080C 870 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 TIF5YPR041W 1218 nt4.32□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 SVF1YDR346C 1446 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 TUB2YFL037W 1374 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 SEG1YMR086W 2883 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YDR249CYDR249C 1122 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 COS12YGL263W 1143 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PRE9YGR135W 777 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLR283WYLR283W 945 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YAR1YPL239W 603 nt4.31□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PRR2YDL214C 2100 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 ROK1YGL171W 1695 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 RIP1YEL024W 648 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YFL068WYFL068W 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PAM18YLR008C 507 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 VTA1YLR181C 993 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 FBP1YLR377C 1047 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 CYM1YDR430C 2970 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 NHX1YDR456W 1902 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 SPS2YDR522C 1509 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YLR345WYLR345W 1530 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 TAF8YML114C 1533 nt4.3□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 PUS9YDL036C 1389 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YGL199CYGL199C 471 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YHB1YGR234W 1200 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 ERG3YLR056W 1098 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 EMG1YLR186W 759 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 BUD17YNR027W 954 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 DRN1YGR093W 1524 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 ZPR1YGR211W 1461 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YER158CYER158C 1722 nt4.29□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 DOS2YDR068W 933 nt4.28□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YIM2YMR151W 438 nt4.28□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YHL012WYHL012W 1482 nt4.28□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 EAR1YMR171C 1653 nt4.28□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 TGL1YKL140W 1647 nt4.28□□□□□ -1.72
NFI1Q12216 YMR111CYMR111C 1389 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 TYR1YBR166C 1359 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 YRM1YOR172W 2361 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 VPS73YGL104C 1461 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 FMC1YIL098C 468 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 BNA1YJR025C 534 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 POC4YPL144W 447 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 TRF5YNL299W 1929 nt4.27□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 SPO73YER046W 432 nt4.26□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 PIC2YER053C 903 nt4.26□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.26□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 PEX22YAL055W 543 nt4.26□□□□□ -1.73
NFI1Q12216 YPL191CYPL191C 1083 nt4.26□□□□□ -1.73
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