Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms