Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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