Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms