Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL18Q07020 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL18Q07020 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL18Q07020 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL18Q07020 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL18Q07020 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL18Q07020 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms