Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms