Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A2Q05940 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC18A2Q05940 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms