Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD164Q04900 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms