Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	SEC2	YNL272C	2280 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	AHA1	YDR214W	1053 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YDR249C	YDR249C	1122 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YRA2	YKL214C	612 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	FLD1	YLR404W	858 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	MET16	YPR167C	786 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	LTV1	YKL143W	1392 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	IES6	YEL044W	501 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YGL118C	YGL118C	438 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YGR269W	YGR269W	327 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YLR326W	YLR326W	723 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YBL077W	YBL077W	432 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RNY1	YPL123C	1305 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	TFA1	YKL028W	1449 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	TDA1	YMR291W	1761 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	LOS1	YKL205W	3303 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YND1	YER005W	1893 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YDR161W	YDR161W	1164 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	OTU1	YFL044C	906 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	ERG26	YGL001C	1050 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	TIS11	YLR136C	858 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YOL050C	YOL050C	321 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	MSW1	YDR268W	1140 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	PHO92	YDR374C	921 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RMR1	YGL250W	726 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	AIM41	YOR215C	558 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	SUI3	YPL237W	858 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	CMR3	YPR013C	954 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	PDR12	YPL058C	4536 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	OAF1	YAL051W	3144 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	BUD13	YGL174W	801 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RPS0A	YGR214W	759 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	NSE1	YLR007W	1011 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	SLX1	YBR228W	915 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RSM23	YGL129C	1353 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YJR026W	YJR026W	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YJR028W	YJR028W	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YAR010C	YAR010C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YML040W	YML040W	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YMR051C	YMR051C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YNL054W-A	YNL054W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YOL103W-A	YOL103W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YPL257W-A	YPL257W-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YPR137C-A	YPR137C-A	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YPR158C-C	YPR158C-C	1323 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	RPS14A	YCR031C	414 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ARD1	YHR013C	717 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YHR173C	YHR173C	339 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YIM2	YMR151W	438 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	NGL3	YML118W	1518 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ALG9	YNL219C	1668 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.82	□□□□□ -1.64

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