Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms