Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL7P80098 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL7P80098 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL7P80098 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL7P80098 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCL7P80098 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL7P80098 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL7P80098 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL7P80098 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL7P80098 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms