Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPM4P67936 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPM4P67936 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPM4P67936 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM4P67936 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM4P67936 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM4P67936 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPM4P67936 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPM4P67936 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPM4P67936 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPM4P67936 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPM4P67936 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM4P67936 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms