Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms