Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOAP61586 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOAP61586 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOAP61586 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOAP61586 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOAP61586 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOAP61586 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOAP61586 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms