Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C21orf59P57076 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C21orf59P57076 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms