Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBASH3AP57075 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms