Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BACE1P56817 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BACE1P56817 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BACE1P56817 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BACE1P56817 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BACE1P56817 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BACE1P56817 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BACE1P56817 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BACE1P56817 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BACE1P56817 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BACE1P56817 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms