Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTSWP56202 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTSWP56202 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTSWP56202 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSWP56202 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTSWP56202 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTSWP56202 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTSWP56202 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTSWP56202 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTSWP56202 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTSWP56202 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CTSWP56202 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTSWP56202 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSWP56202 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms