Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P54278 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P54278 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS2P54278 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS2P54278 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS2P54278 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS2P54278 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS2P54278 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS2P54278 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS2P54278 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS2P54278 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS2P54278 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS2P54278 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS2P54278 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS2P54278 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms