Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 YHR127WYHR127W 732 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 LNP1YHR192W 837 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YJL032WYJL032W 315 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PSF2YJL072C 642 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 NIT2YJL126W 924 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 FYV6YNL133C 522 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SPS19YNL202W 879 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YOR114WYOR114W 885 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SBE2YDR351W 2595 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PMT4YJR143C 2289 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SHE9YDR393W 1371 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 THP1YOL072W 1368 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SEG2YKL105C 3399 nt4.76□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TGL4YKR089C 2733 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CPS1YJL172W 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TRM13YOL125W 1431 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 KIN28YDL108W 921 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YDR042CYDR042C 603 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SUR2YDR297W 1050 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 LST7YGR057C 729 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 AAD10YJR155W 867 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TEF4YKL081W 1239 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YLR202CYLR202C 327 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PML39YML107C 1005 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YNR025CYNR025C 360 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MCT1YOR221C 1083 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ETR1YBR026C 1143 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CDC28YBR160W 897 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 LDH1YBR204C 1128 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ROT2YBR229C 2865 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ABF1YKL112W 2196 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 IKS1YJL057C 2004 nt4.75□□□□□ -1.65
SNF12P53628 AXL2YIL140W 2472 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TFC7YOR110W 1308 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ARP2YDL029W 1176 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SLC1YDL052C 912 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YER085CYER085C 522 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 STE2YFL026W 1296 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SEH1YGL100W 1050 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 HTD2YHR067W 843 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RPB4YJL140W 666 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TPP1YMR156C 717 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PNO1YOR145C 825 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CNS1YBR155W 1158 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ARO4YBR249C 1113 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RGP1YDR137W 1992 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 LAP3YNL239W 1365 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SSU1YPL092W 1377 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PHO8YDR481C 1701 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CRT10YOL063C 2874 nt4.74□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TIM54YJL054W 1437 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MDM38YOL027C 1722 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SOL3YHR163W 750 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RFA3YJL173C 369 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MRPL13YKR006C 795 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SMD2YLR275W 333 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YLR462WYLR462W 609 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YPR202WYPR202W 717 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RPS9BYBR189W 588 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SFI1YLL003W 2841 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 FUI1YBL042C 1920 nt4.73□□□□□ -1.65
SNF12P53628 PGM2YMR105C 1710 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TYW1YPL207W 2433 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 snR7-LsnR7-L 214 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CTH1YDR151C 978 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YJL068CYJL068C 900 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 CDC8YJR057W 651 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YAL069WYAL069W 315 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RIF2YLR453C 1188 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SHE1YBL031W 1017 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 SCW10YMR305C 1170 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 YOL106WYOL106W 354 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 RPB8YOR224C 441 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 ARA1YBR149W 1035 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MMT2YPL224C 1455 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MSH1YHR120W 2880 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 TPO2YGR138C 1845 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 GAS4YOL132W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
SNF12P53628 MOT2YER068W 1764 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 PEX29YDR479C 1665 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 KNH1YDL049C 807 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 MLC1YGL106W 450 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 DAM1YGR113W 1032 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 YGR269WYGR269W 327 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 RCN1YKL159C 636 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 DOA1YKL213C 2148 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 BOS1YLR078C 735 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 CPR3YML078W 549 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 IRC13YOR235W 315 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 TMA16YOR252W 537 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 ATP20YPR020W 348 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 SPP381YBR152W 876 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 BBC1YJL020C 3474 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 MDL1YLR188W 2088 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 MCM2YBL023C 2607 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 YND1YER005W 1893 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 ORC6YHR118C 1308 nt4.71□□□□□ -1.66
SNF12P53628 OCT1YKL134C 2319 nt4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms