Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOSBP53539 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
FOSBP53539 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
FOSBP53539 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FOSBP53539 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOSBP53539 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOSBP53539 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOSBP53539 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOSBP53539 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOSBP53539 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOSBP53539 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOSBP53539 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOSBP53539 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms