Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1GP51170 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCNN1GP51170 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCNN1GP51170 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCNN1GP51170 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1GP51170 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1GP51170 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms