Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN1BP46527 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms