Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD52P43351 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD52P43351 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD52P43351 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD52P43351 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD52P43351 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD52P43351 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD52P43351 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD52P43351 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD52P43351 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms