Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL35P42766 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL35P42766 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms