Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTRLP40313 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms