Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPB2P35606 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPB2P35606 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COPB2P35606 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPB2P35606 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms