Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A1P32418 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms