Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms