Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1CAMP32004 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1CAMP32004 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms