Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A5P29400 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms