Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD27P26842 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD27P26842 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD27P26842 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD27P26842 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD27P26842 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD27P26842 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD27P26842 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD27P26842 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD27P26842 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms