Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA1P25391 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms