Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP1P23763 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP1P23763 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms