Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP100P23497 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP100P23497 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP100P23497 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP100P23497 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP100P23497 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP100P23497 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP100P23497 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP100P23497 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP100P23497 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP100P23497 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP100P23497 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP100P23497 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms