Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VCAM1P19320 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms