Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFTRP13569 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFTRP13569 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFTRP13569 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFTRP13569 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFTRP13569 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CFTRP13569 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFTRP13569 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFTRP13569 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFTRP13569 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFTRP13569 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFTRP13569 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFTRP13569 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFTRP13569 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFTRP13569 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFTRP13569 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFTRP13569 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFTRP13569 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFTRP13569 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFTRP13569 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFTRP13569 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFTRP13569 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFTRP13569 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFTRP13569 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFTRP13569 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFTRP13569 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFTRP13569 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFTRP13569 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFTRP13569 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFTRP13569 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFTRP13569 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFTRP13569 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CFTRP13569 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
CFTRP13569 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFTRP13569 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFTRP13569 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFTRP13569 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CFTRP13569 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFTRP13569 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFTRP13569 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CFTRP13569 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms