Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
COX4I1P13073 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX4I1P13073 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX4I1P13073 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COX4I1P13073 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX4I1P13073 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX4I1P13073 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX4I1P13073 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX4I1P13073 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms