Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DEFA4P12838 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEFA4P12838 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms