Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIP12755 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIP12755 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIP12755 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIP12755 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIP12755 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIP12755 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIP12755 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIP12755 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIP12755 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIP12755 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIP12755 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIP12755 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIP12755 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIP12755 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIP12755 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms