Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKBP12277 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKBP12277 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKBP12277 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKBP12277 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKBP12277 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKBP12277 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKBP12277 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKBP12277 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKBP12277 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms