Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODC1P11926 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ODC1P11926 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODC1P11926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODC1P11926 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ODC1P11926 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms