Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LAMC1P11047 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LAMC1P11047 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms