Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THRAP10827 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP10827 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THRAP10827 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP10827 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP10827 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP10827 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP10827 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP10827 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP10827 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP10827 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRAP10827 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRAP10827 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms