Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC192P0DO97 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC192P0DO97 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms