Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA6AP0CW24 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms