Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00032P0C843 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00032P0C843 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms