Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UQCRFS1P1P0C7P4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UQCRFS1P1P0C7P4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UQCRFS1P1P0C7P4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms