Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A2P08572 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A2P08572 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms